黄小云^1,2 , 陶鹏² , 王五宏² , 李必元² , 岳智臣² , 雷娟利² , 钟新民²

1 南京农业大学园艺学院, 南京, 210095;
2 浙江省农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12 卷, 第 13 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.000296
收稿日期: 2013年07月24日    接受日期: 2013年10月08日    发表日期: 2014年02月14日

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热激转录因子(heat shock transcription factors, Hsfs)是调节植物响应高温胁迫的主要因子，参与调节热激蛋白(heat shock protein, Hsp)的表达，对植物抵抗高温逆境等生命活动具有关键作用。本研究以大白菜和甘蓝基因组数据为基础，利用生物信息学方法对大白菜和甘蓝整个基因组的Hsf基因家族进行鉴定与分析。结果表明，大白菜至少含有30个Hsf基因成员，蛋白长度在239~487氨基酸之间；甘蓝至少含有36个Hsf基因成员，蛋白长度在219~495氨基酸之间。序列比对发现，大白菜和甘蓝Hsf基因都具有高度保守的DBD (DNA binding domain)结构域和广泛的保守基序；染色体定位发现，大白菜和甘蓝Hsf基因家族成员广泛的分布在各染色体上。此外，对拟南芥、大白菜和甘蓝Hsfs的系统发育分析表明，这些Hsf基因家族成员可以分为A、B、C三类，A类和B类可进一步分为8个和4个亚类，A类Hsfs的保守性明显高于B类和C类。系统发育树还揭示了在这三个物种中，共存在28对直系同源基因和2对旁系同源基因，表明Hsf转录因子在大白菜、甘蓝和拟南芥基因组中具有广泛的共同祖先，Hsf基因家族的多样化存在于十字花科植物分化之前，并且在甘蓝基因组中发生了基因重复。

大白菜；甘蓝；热胁迫；热激转录因子；生物信息学；系统发育关系